MicroGIS a été créée en janvier 1996 à Yverdon-les-Bains (Suisse) par quatre géographes dont l'idée était de mettre les apports de l'analyse spatiale et de la représentation cartographique au service des activités économiques.

MicroGIS au fil du temps:

• 1996:  création de MicroGIS Sàrl à Yverdon-les-Bains
• 1996: partenariat avec l'OFS, revente de données statistiques  spatialisées
• 1998: partenariat avec Le Temps, cartographie électorale
• 1999 : transformation de MicroGIS en Société Anonyme
• 2000: partenariat avec Le Bund, cartographie électorale
• 2001: début des activités dans le domaine du webmapping
• 2004: début des activités dans le domaine de l'aménagement du territoire
• 2006: ouverture du bureau de Zürich
• 2007: début des activités dans le domaine de l'anthropologie culturelle et de la génétique spatiales
• 2008: partenariat avec la Poste Suisse sur l'offre de géodonnées ZipCodes⁺